系統樹作成アルゴリズムの性能評価実験

西村　久香

【概要】

3つの手法で作成された距離表と2種類の距離法をそれぞれ
組み合わせて用い、進化系統樹を推定し比較実験する

資料
卒業研究発表スライド sxi
卒業研究発表レジュメ pdf
LEDA
有根系統樹作成プログラム UPGMA.c
無根系統樹作成プログラム NJ_LEDA.c
Kolmogorov記述量の距離を算出するプログラム Kolmogorov.c
script
全ファイルにbzip2をかける loop_bzip.sh
同一ディレクトリ内のファイル名のリストを作る make_list.sh
同一ディレクトリ内の全ファイル（形式指定）を連結 all_cat.sh

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